Τα μονομερή των πρωτεϊνών είναι τα αμινοξέα. Το μόριο των αμινοξέων αποτελείται από δύο τμήματα, ένα σταθερό και ένα μεταβλητό. Το σταθερό αποτελείται από ένα άτομο υδρογόνου, μία αμινομάδα και μία καρβοξυλομάδα ενωμένα σε ένα μόριο άνθρακα, ενώ το μεταβλητό αποτελείται από την πλευρική ομάδα η οποία έχει διαφορετική χημική δομή για κάθε αμινοξύ.