Transkripcio szabalyozasa

• A génexpresszió szabályozása

  eukariótákban


  Befolyásolja a promóter erőssége, represszorok és aktivátorok, transzkirpciós “pausing” és “arrest” és a processzálás sebessége
• A transzkripciós szabályozás szerepe

  A sejtben a megfelelő típusú és mennyiségű RNS és fehérje. Függ az időtől, környezeti hatásoktól, sejttípustól és fejlődéstől.
• Prokariótában


  A szabályozó szakaszok különböző elhelyezkedése a promóterhez viszonyítva. Promóter mellett aktivátor kötődése közvetlenül aktiválja a transzkripciót. Átfedésben lévő szekvenciák: represszor

  kötődése gátolja az RNS Pol kötődését. Több száz vagy több bázispárral feljebb

  kötődő szabályozó fehérjék

  befolyásolják a promóter

  transzkripcióját a DNS hurokképződését.
• A transzkripció szabályozása


  RNS struktúrája gátolhatja vagy serkentheti a transzkripcíót, fehérjefaktorok megváltoztathatják az RNS szerkezetét. Enjancer DNS szekvenciák szabályozó fehérjéket tudnak kötni és képesek DNS hélix hajlításra
• Mi befolyásolja a transzkripció szabályozását?

  A promóter erőssége, represszorok és aktivátorok, transzkripciós „pausing” és „arrest”, valamint a processzálás sebessége
• Mi a transzkripciós szabályozás szerepe a sejtben?

  A megfelelő típusú és mennyiségű RNS és fehérje előállítása
• Milyen tényezők befolyásolják a génexpressziót eukariótákban?

  Idő, környezeti hatások, sejttípus és fejlődés
• Milyen különbségek vannak a prokarióták és eukarióták génexpressziójának szabályozásában?

  • Prokarióták: szabályozó szakaszok különböző elhelyezkedése a promóterhez viszonyítva
  • Eukarióták: aktivátorok közvetlenül aktiválják a transzkripciót
  • Represszorok gátolják az RNS polimeráz kötődését
• Mi a fő transzkripciós szabályozás célja?

  A transzkripció iniciációjának szabályozása
• Hogyan befolyásolhatja az RNS struktúrája a transzkripciót?

  Az RNS struktúrája gátolhatja vagy serkentheti a transzkripciót
• Milyen szerepet játszanak az enhancer DNS szekvenciák a transzkripció szabályozásában?

  Regulátor fehérjéket tudnak kötni, amelyek távol is eshetnek a promótertől
• Mi az alloszterikus szabályozás?

  Kis molekula kötődése a szabályozó fehérjéhez, ami megváltoztatja a konformációt
• Milyen mechanizmusok befolyásolják a transzkripciós regulátorok hatását?

  • Aktivátorok csoportokban hatnak
  • Kombinációs szabályozás: fehérjék meghatározott csoportja kötődik
  • Összhatás: aktiválás vagy gátlás
• Mi a mediátor szerepe a transzkripcióban?

  A mediátor kapcsolatban van az aktivátorokkal, ko-aktivátorokkal, TF-okkal és RNS polimerázzal
• Mi az inzulátorok funkciója?

  Megakadályozzák, hogy a szabályozó szekvenciák nem megfelelő géneket aktiváljanak
• Milyen fő útvonalakon hatnak az aktivátorok a transzkripcióra?

  • Más regulátorok kötődését segítik
  • Az RNS polimerázt a promóterhez vonzzák
  • Elongáció kezdetét segítik
• Hogyan hatnak a represszorok a transzkripcióra?

  Aktivátor és represszor vetélkedése a kötőhelyért, valamint közvetlen kölcsönhatás transzkripciós faktorokkal
• Mi az „összhatás” jelentősége a transzkripció szabályozásában?

  A különböző módosító fehérjék hatása összesített hatásuk révén befolyásolja a transzkripció elindulását
• Mi az alternatív splicing?

  Gének 75%-ának alternatív splicingja magasabb rendű eukariótákban
• Milyen lehetőségei vannak az alternatív splicingnak?

  • Mindig két alternatíva
  • Két különböző mRNS
  • Exonok megmaradnak vagy eltávolításra kerülnek
• Hogyan határozzák meg a hasítási helyet?

  Kotranszkripcionálisan – CTD és U1 interakciója
• Mi az EJC szerepe a hasítási hely meghatározásában?

  Az exon junction complex segít a rejtett hasítási helyek és intronok lefedésében
• Mi történik az RNS editing során?

  Specifikus nukleotidok más nukleotiddá konvertálódnak
• Mi a szerepe az Apo B-100 és Apo B-48 fehérjéknek?

  Apo B-100 a májban, míg Apo B-48 a bélben található, és különböző lipid transzport funkciókat látnak el
• Mi az RNS féléletidő emlős sejtek mRNS-e esetén?

  20 perc – 24 óra
• Milyen tényezők befolyásolják az RNS-ek stabilitását?

  A struktúra, mint a cap, poly(A) és AU-gazdag elemek
• Hogyan hat a c-fos és v-fos az RNS stabilitására?

  A c-fos növekedést serkentő transzkripciós szabályozó, míg a v-fos mutált virális forma, amely tumort okozhat
• Milyen RNS bontó folyamatok léteznek?

  • 3’ UTR: nem átíródó szakasz
  • Poly(A) rövidülés
  • Cap struktúra eltávolítása
  • 3’ – 5’ bomlás
• Mi az RNS interferencia (RNSi) szerepe?

  Idegen RNS elleni védekezés és génszabályozó eszköz
• Mi történik az RNS interferencia (RNSi) során?

  A dsRNS a cél mRNS-sel azonos szekvenciát hordoz, ami szabályozást eredményez
• Milyen lépésekből áll az RNS interferencia folyamata?

  1. dsRNS hasítása a dicer enzimmel
  2. siRNS beépül a RISC-be
  3. Cél RNS hasítása
  4. Transzláció gátlása
  5. Cél RNS-t kódoló DNS heterokromatinná alakítása
• Mi a micro RNS-ek szerepe?

  A transzláció gátlása a mRNS komplementer szakaszához való kötődés révén
• Mi a long non-coding RNA funkciója?

  Fehérjék csoportja számára szerkezeti vázat biztosít, valamint transzkripciós szabályozásban játszik szerepet
• Mi a CRISPR rendszer működése?

  • Vírus DNS hasítása után integrálódik a bakteriális genomba
  • Átíródik RNS-sé, processzálódik és Cas fehérjékhez kötődik
  • Ismételt vírus infekció esetén crRNS és Cas komplex lebontja a virális DNS-t
• Milyen kísérleti alkalmazásai vannak a CRISPR rendszernek?

  • Génszakasz „cseréje” homológ rekombinációval
  • Gén expresszió kontrollja (aktiválás vagy represszió)