wykorzystywany do leczenia opryszczki, ospy wietrznej, półpaśca
do niego w komórkach zarażonych HSV-1, w obecności enzymu wirusowego (kinaza tymidynowa), zostaje przyłączona pierwsza grupa fosforanowa
kolejne fosforylacje są możliwe dzięki enzymom zainfekowanej komórki (acyklowir uzyskuje aktywność w wyniku 3 kolejnych etapów fosforylacji)
po fosforylacji przypomina fosfonukleozyd, ale nie zawiera grupy -OH
przez to działa jako sygnał kończący replikację
wirusowa polimeraza DNA podczas replikacji wprowadza do łańcucha DNA wirusa ufosforyzowany acyklowir zamiast prawidłowego nukleotydu
komórkowa polimeraza DNA nie jest wrażliwa na trifosforan acyklowiru