Informationsgewinnung

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  • Primärliteratur = Erstveröffentlichung wissenschaftlicher Forschungsergebnisse (z. B. Diplomarbeiten, Dissertationen, Patente, etc.) -> wichtig: Reproduzierbarkeit
    Gliederung: Abstract, Introduction, Methods, Results, Discussion, References, Supplementary material
  • Sekundärliteratur = Überblick über den Inhalt von vielen Originalarbeiten (z. B. Reviews, Übersichtsartikel, etc.)
  • Tertiärliteratur = Zusammenstellung von unterschiedlichen Quellen ohne diese vollständig zu zitieren (z. B. Lehrbücher, Lexika, Sachbücher für Laien)
  • PharmaWiki beschäftigt sich mit Wirkstoffen bzw. Arzneimittel und Arzneistoffen -> Wirkstoff in Wirkstoffklassen eingeteilt
  • Literaturdatenbanken (wie PubMed) sind meist durch Fördergelder entwickelt -> keine Volltextsuche, ist eine Sammlung von Reviews und Abstracts und Articles (Reviews und Originaltexte werden referenziert)
  • Datenbanken von Originaldaten:
    für chemische Verbindungen = SciFinder oder Chemspider
    für Proteine = UniProt oder Pdb (= Protein data bank)
    für biologische Daten = ChEMBL oder PubChem
  • SciFinder CAS (=chemical Abstract): kein open access, aber UniWien hat Campuslizenz -> beste Coverage aller chemischen Datenbanken (ist auch mit PubMed verknüpft) - Website gibt Substanz und ihre chemische Struktur an
  • ChemSpider verknüpft 500 Datenquellen -> "Synonymlexikon“ (Suche auf Name oder Struktur + IUPAC-Name)
  • UniProt gibt Informationen über Proteine sowie ihre Sequenz und die Identifikationsnummer
  • ChEMBL gibt Informationen zu allen bekannten bioaktiven Molekülen
  • Pdb ist eine Sammlung aller experimentell bestimmter 3D-Strukturen der Proteine
  • ChEMBL nimmt Daten aus Originalliteratur -> manuell kurierte Strukturen -> erste Anlaufstelle für Substanzraum
  • PubChem hat mehr Substanzen als ChEMBL -> Hochladen ist möglich
  • künstliche Intelligenz kann schnelle und kurze Definitionen einzelner Begriffe (eher oberflächlich) von sich geben, gibt aber bei komplexeren Fragen (vgl. Imid-Teilstruktur) falsche Informationen -> Verwechslungsgefahr zwischen Teilstrukturen, kann aber richtige Strukturformel geben mit einer falschen Erklärung
    -> auch falsche oder erfundene Literatur kann angegeben sein