Cellule

• Fimbriae: adhésion aux surfaces => augmentent la virulence (fixation sur cellule hôte lors de l’infection)
• Nucleoïde: “noyau” des procaryotes (ADN, ARN et protéines), pas de membrane
• Ribosomes: usines à protéines
• Membrane plasmique: barrière à la diffusion (pas cholestérol —> hopanoïdes) 
• Paroi cellulaire: protection et stabilisation mécanique (peptidoglycane)
• Capsule: structure (souvent polysaccharides) à l’extérieur de la membrane plasmique et paroi cellulaire => protection et facteur de virulence
• • Flagelles: locomotion
• Gram positif: Coloration violette => Une seule membrane + couche épaisse et accessible de peptidoglycans
• Gram négatif: coloration rose

  Membrane interne-Fine couche peptidoglycans-Membrane interne => peptidoglycans pas accessibles à la coloration
•  Les cellules animales sont très mobiles. 
• Organites spécifiques aux cellules animales: lysosomes, Centriole
• Le noyau: centre d’information (contient le génome), réplication, transcription 
• Nucléole: assemblage des ribosomes
• Enveloppe nucléaire: membrane double continue avec le RE, contient des pores nucléaires => transport de protéines entre le noyau et le cytosol => les signaux de localisation nucléaire dirigent les protéines nucléaires vers le noyau. 
• Fonction des mitochondries: respiration cellulaire = powerhouse of the cell
• Ribosomes libres dans le cytoplasme: synthèse de protéines destinées au cytosol

  Ribosomes liés au RE: synthèse de protéines transmembranaires ou sécrétées dans l’espace extracellulaire
• Fonctions RE: fabrication des lipides, membranes et protéines destinées à la sécrétion
• Système endomembranaire

  1. Protéines synthétisée dans RE 
  2. Sécrétion par RE et transportée dans une vésicule jusqu’au côté cis de l’appareil de Golgi
  3. Maturation par l’appareil de Golgi 
  4. Sécrétion du côté trans et transportées dans des vésicules de transport => exocytose
• Translocation d’une protéine sur le RE: post-traductionnelle ou cotraductionnelle
• translocation cotraductionnelle:

  1. Traduction d’un signal de translocation 
  2. Fixation du SRP (signal recognition particule) => pause dans la traduction 
  3. Complexe ciblé sur un translocateur sur la membrane du RE
  4. Traduction recommence et SRP libéré
• La partie de la protéine dans le lumen du RE est destinée au milieu extracellulaire
• Protéines transmembranaire type I

  La séquence de signal clivée reste dans la membrane du RE (hélice alpha avec chaîne latérales hydrophobes)

  1. Séquence signal reconnue par SPR => traduction en pause
  2. Complexe ciblé vers une translocateur sur la membrane du RE
  3. Séquence signal clivée par peptidase 
  4. Traduction reprend => lumen du RE
  5. Séquence d’arrêt transfert (AA chargés +/-)
  6. Traduction continue dans le cytosol
  7. Protéine libérée du translocatour
• Protéine transmembranaire type II: pas de séquence signal

  1. Traduction 
  2. Séquence de signal d’ancrage => complexe ciblé sur translocateur
  3. Traduction dans le lumen du RE
  4. Protéine libérée du translocateur
• Glycosylation: modification par un sucre dans Re ou appareil de Golgi
• N-glycosylation: Dans le RE, N lié de manière covalente à un N-acetylglucosamine
• O-glycosylation: dans l’appareil de Golgi, O lié de manière covalente à un N-acetylegalactosamine
• Appareil de Golgi: Organisé en citernes (pas de connexion entre les citernes) et orienté (côté cis/trans)

  Fonction: maturation des protéines sécrétrices et membranaires (ex. ajout d’un sucre), vésicules du côté trans pour exocytose
•  Lysosomes:

  1. Endocytose de  « déchets »  
  2. Fusion avec lysosomes contenant des enzymes hydrolytiques (pH très acide) => digestion
• Les cellules végétales n’ont pas de lysosomes => vacuole avec un pH très acide pour la digestion
• autophagie: mécanisme des lysosomes de recycler ou éliminer des déchets cellulaires
• Phagocytose: internalisation de grandes particules solides (pathogènes, débris cellulaires, …)
• Endocytose par récepteur interposé

  Récepteurs spécifiques à la substances cibles => récepteurs recyclés (ramenés vers la membrane extracellulaire)

  Vésicules enrobées de clathrine 

  => endosymbiose des mitochondries (procaryote non photosynthétique aérobie) et des chloroplastes (procaryote photosynthétique)
• Pinocytose: Aucune spécificité des vésicule => internalisation de liquide (particules dissoutes)
• Peroxysomes:

  une seule membrane

  Production de peroxyde d’oxygène qu’ils oxydent en eau

  On ignore comment les peroxysomes sont liés à d’autres organites
• La paroi cellulaire empêche les cellules végétales de bouger => très serrées les unes aux autres
• Organites spécifiques aux cellules végétales:

  Chloroplastes: photosynthèse

  Vacuole et son tonoplaste: stockage et dégradation

  Paroi cellulaire: stabilisation et protection 

  Plasmodesmes:  intercellulaire
• Membranes biologiques

  • Fonction: barrière à la diffusion => protège le cytosol
  • Cristal liquide
• mouvement brownien: mouvement aléatoire des molécules en solution qui amène à l’équilibre

  Si la température augmente, le mouvement brownien augmente => diffusion plus rapide à température élevée
• La perméabilité d’une membrane lipidique dépend de la taille, charge et hydrophobicité des protéines
• Osmose = diffusion à travers une membrane semi-perméable