Techniques d’analyse intéressantes pour distinguer les différentes populations neuronales sont la technique de «binding (liaison)» avec un traceur radioactif pour détection de récepteurs aux neurotransmetteurs, l’hybridation « in situ » pour détection d'ARN messagers de neurotransmetteur (neuropeptide), et l’immunohistochimie pour travailler à l’échelle de la protéine même, en utilisant des anticorps, dont l’antigène reconnu va être spécifique d’un neurotransmetteur, d’un récepteur etc.