Hypotalamus fungerer som et viktig kontrollpunkt i kroppen, den mottar informasjon fra ulike deler av kroppen og spiller en sentral rolle i reguleringen av mange organer og livsnødvendige prosesser. Blant annet styrer den sult, tørst, tretthet og ulike følelser. Når kroppstemperaturen stiger, gir hypotalamus beskjed til det perifere nervesystemet om å aktivere svetteproduksjon for å kjøle ned kroppen.