Sovrapposizione della basilica costantiniana a cinque navate e del progetto di papa Niccolò 5.
Prima idea: schema a quinconce (una cupola centrale e quattro perimetrali). Uno dei piloni è disegnato vicino alla cupola. Le navate laterali includono due coppie di pilastri.
Seconda idea: irrobustimento e definizione planimetrica del pilone (faccia verso l' invaso cupolato), creazione di tre esedre con deambulatorio, ampliamento della navata.
Dopo l'intervento di Raffaello, la basilica avrà l'aspetto stabilito dal trattato di Sebastiano Serlio.