chimica delle proteine e catalisi enzimatica

• Funzioni delle proteine

  • strutturali
  • contrattili
  • di riserva
  • di difesa
  • di trasporto
  • segnale
  • enzimi
  • motore molecolare
• Cosa sono le proteine?

  sono polimeri di AA legati fra loro con un legame peptidico
• Legame peptidico


  è un legame ammidico, si forma fra l'amminogruppo del primo AA e il gruppo carbonile del secondo AA
• Amminoacidi principali

  1. Glicina
  2. Alanina
  3. Valina
  4. Leucina
  5. Isoleucina
  6. Prolina
  7. Fenoftaleina
  8. Tirosina
  9. Triptofano
  10. Serina
  11. Treonina
  12. Cisteina
  13. Metionina
  14. Acido aspartico
  15. Acido glutammico
  16. Asparagina
  17. Glutammina
  18. Lisina
  19. Arginina
  20. Istidina
• Proteine


  polimeri di alfa, L amminoacidi
• esempi di amminoacidi D

  si trovano nei batteri: D-alanina
• Cosa vuol dire che un amminoacido è alfa?

  vuol dire che ha il gruppo amminico si trova il psizione alfa al carbonile
• eccezione amminoacidi alfa

  • GABA: acido gamma-amminobutirrico
  • acido epsilon-amminocaronico
• Legame peptidico

  due strutture limite: RISONANZA
• Gradi di libertà

  il legmane C-N è fisso: perché è ibrido

  Gli unici legami che possono ruotare sono N-C e C-C

  • a seconda del gruppo funzionale presente (ingombro steico) ci sanno più o mmeno angoli che può assumere il legame
• Struttura prmmaria

  è la sequenza a che parte dal AA amminoterminale e terinacon l'AA carbossiterminale
• Descrivere angoli diedri

  ingombro sterico impediscce la rotazione
• Diagrama di Ramachandran

  descrive le regioni stericamente permesse di phi e psi