Aminoácidos

• Características de los aminoácidos:

  • 20 aminoácidos forman 1 proteína
  • 19/20 son quirales
  • Su estereoquímica es L
  • Provienen del código genético
• Comportamiento ácido-base:

  • Ácido: Donador de H+ (ARRIBA)
  • Base: Aceptor de H+ (ABAJO)
  • Punto isoeléctrico (pI) = nivel de pH en el cual la carga neta es 0
  • pH menor que pka = acepta H+ = carga (+)
  • pH mayor que pka = dona H+ = carga ( - )
  • pka = NH2, COO -, NH3+, COOH
• Niveles de estructura de las proteínas:

  • Nivel Primario: Secuencia de aminoácidos de un polipéptido, enlace peptídico
  • Nivel Secundario: Plegamiento 3D regional de un polipéptido, hélices alfa, hoja Beta plegada
  • Nivel Terciario: Plegamiento 3D total de un polipéptido, hioglobina, enlace disulfuro, enlace iónico, puentes de H+, interacciones hidrofóbicas
  • Nivel Cuaternario: Plegamiento 3D completo de todos los polipéptidos que forman una proteína multimérica, hemoglobina, enlace disulfuro, enlace iónico, puentes de H+, interacciones hidrofóbicas
• Ciclo de vida de una proteína hipotética:

  1. Síntesis en un ribosoma de una cadena polipeptídica, cuya estructura primaria está dictada por un ARNm

  2. Plegamiento hacia su conformación natural

  3. Procesamiento: división proteolítica de una secuencia líder N terminal o formación de enlaces disulfuro

  4. Modificación covalente: fijación de una molécula de ácido graso

  5. Translocación de una proteína modificada hacia una membrana

  6. Activación: unión de efector alostérico desencadena la adopción de una conformación catalíticamente activa
• 7. Catálisis: las proteínas quedan dañadas por el ataque de sustancias químicas, desamidación o desnaturalización

  8. Envejecimiento: proteínas "marcadas" mediante la fijación covalente de varias moléculas de ubiquitina

  9. Ubiquitinación: proteína ubiquitinada se degrada a aminoácidos y queda para la nueva síntesis de proteínas

  10. Dominios proteicos: entre el nivel secundario y terciario de una proteína, hay dominios proteicos que son un conjunto de estructuras 2° con función específica
• Aminoacidos Alifáticos

  • glicina
  • alanina
  • valina
  • Leucine
  • isoleucina
  • prolina
• aminoácidos grupo hidroxilo (OH)

  • serina
  • trionina
• aminoácidos con azufre

  • cisteina
  • metionina
• aminoácidos ácidos

  • ácido aspaártico
  • ácido glutámico
• aminoácidos con amida

  • aspargina
  • glutamina
• aminoácidos básicos

  • Arginina
  • Lisina
  • Histidina
• aminoácidos aromáticos

  • fenilalanina
  • tirosina
  • triptófano