Om vol te houden in een niche kunnen sommige bacteriën toxines produceren. zoals superantigen, toxinen met een intracellulaire werking en enzymes voor het binnendringen van de cel
toxines met een intracellulaire werking hebben een A-B opbouw. B bind aan de receptor van de te binnen dringen cel. A bevat intracellulaire enzymatische activiteit.
Sommige bacteriën kunnen ook endotoxines produceren. Dit gebeurt wanneer ze afgebroken worden door macrofagen. deze zullen zorgen voor heftige koorts en soms zelfs shock.
Belangrijke enzymen die de bacteriën gebruiken bij het penetreren van een celwand van een cel waar in willen zitten om het immuunsysteem te vermeiden. deze enzymen heten:
coagulase
streptokinase
hyaluronidase
superantigenen activeren T-cellen
Er zijn soorten salmonella
generalisten; hebben veel verschillende soorten hosten en niches
host-restricted; hebben maar een kleine hoeveelheid verschillende hosten.