Quando se inicia o Terror (que perseguia e executava todos os que se opunham à política revolucionária), este Comité foi responsável por: Perseguir e prender milhares de suspeitos de serem contra-revolucionários; Julgar e condenar à morte milhares de pessoas, muitas vezes sem um julgamento justo; Implementar medidas repressivas, como a censura e a Lei dos Suspeitos (obrigava ao recenseamento de todos os desaprovavam abertamente a política revolucionária e permitia a sua prisão).