clase 7

• Unidad 2 Clase 4
• Docente: Alvaro Díaz
• Las proteínas
• Objetivo iv de la guía de estudio disponible en el sitio web: http://bilbo.edu.uy/~biol/estudiantes/guiaestudio/icb1/Unidad2/unidad2_1.html
• Unidad 2. Clase 7. Proteínas: introducción general, unión peptídica, secuencia, conformación

  
• Objetivos de esta clase

  • Comprender la centralidad de las proteínas en todos los procesos celulares, así como la amplia variedad de formas y funciones mostrada por estas moléculas
  • Incorporar el concepto de que las proteínas son macromoléculas en las que cada átomo en principio tiene una posición definida
  • Comprender a un nivel básico los aminoácidos, incluyendo saber identificar el átomo de C "alfa"
  • Comprender cómo se asocian covalentemente aminoácidos para dar péptidos, incorporando los conceptos de esqueleto principal, cadenas laterales y extremos amino y carboxilo
  • Incorporar el concepto de secuencia de residuos aminoacídicos
  • Incorporar los conceptos de conformación nativa de una proteína, y desnaturalización
  • Comprender a un nivel básico cómo es que la secuencia determina la conformación nativa de las proteínas

  
• Funciones de las proteínas

  • generación de estructuras
  • catálisis de reacciones
  • transporte de moléculas
  • movimiento
  • transmisión y procesamiento de información
  • regulación de la expresión de genes
  • almacenamiento de nutrientes
• Proteínas


  Las vigas, los engranajes, las poleas, los chips de la célula
• Las proteínas son actores centrales en todos los procesos celulares
• La gran variedad de funciones de las proteínas es posible debido a una gran variedad de formas (y tamaños) moleculares
• Una enzima típica tiene unos 5 nm de diámetro
• Las proteínas son moléculas compuestas por miles de átomos, en las cuales cada átomo tiene una posición definida

  
• La superficie de una proteína dada tiene muchísimas regiones con características químicas diferentes. Más específicamente, regiones con diferente capacidad de formar interacciones no covalentes con otras moléculas
• Aminoácido


  Molécula que tiene un grupo amino y un grupo ácido carboxílico

  
• Carbono "alfa"


  Átomo de carbono al que se unen el grupo amino, el grupo carboxilo y la cadena lateral

  
• Los aminoácidos que forman las proteínas son un subconjunto de los aminoácidos, caracterizado porque el grupo amino y el carboxilo están unidos al mismo átomo de C

  
• El sustituyente, en este contexto llamado "cadena lateral", es que el distingue a cada uno de los 20 aminoácidos formadores de proteínas

  
• Las cadenas laterales de los aminoácidos formadores de proteínas tienen un amplio rango de propiedades químicas diferentes

  
• Formación de péptidos


  1. Los aminoácidos se conectan a través de uniones amida

  2. La condensación entre carboxilo y amino no es favorable en el medio acuoso: la reacción en realidad ocurre con un paso intermedio, que aquí no está mostrado

  
• Péptidos


  Moléculas formadas por la unión de aminoácidos a través de uniones peptídicas

  
• No todos los péptidos son proteínas: las proteínas son péptidos grandes (polipéptidos) que tienen, como veremos más adelante, una forma (conformación) definida, y una función biológica

  
• Unión peptídica


  Grupo amida que conecta a dos Ca de un péptido

  
• A partir de dos aminoácidos diferentes se pueden formar dos dipéptidos diferentes (en este caso, glicilalanina y alanilglicina)

  
• Los péptidos son polímeros lineales, que tienen dos extremos químicamente diferentes
• Todo péptido tiene una unión peptídica menos que el número de aminoácidos que lo formaron

  
• Residuo aminoacídico


  Parte del péptido que proviene de un aminoácido individual (menos los átomos que se perdieron en la condensación)

  
• Cada péptido se caracteriza por su secuencia de residuos aminoacídicos, la cual se escribe de extremo amino a extremo carboxilo

  
• Secuencia en código de tres letras
• Secuencia en código de una letra
• Simplificación de esqueleto principal y cadenas laterales
• Número de residuo
• liiksge slrikalvqg rpvprvtwfk 8341 dgveiekrmn meitdvlgst slfvrdatrd hrgvytveak nasgsakaei kvkvqdtpgk 8401 vvgpirftni tgekmtlwwd aplndgcapi thyiiekret srlawalied kceaqsytai 8461 klingneyqf rvsavnkfgv grpldsdpvv aqiqytvpda pgipepsnit gnsitltwar 8521 pesdggseiq qyilerrekk strwvkvisk rpisetrfkv tgltegneye fhvmaenaag 8581 vgpasgisrl ikcrepvnpp gpptvvkvtd tskttvslew skpvfdggme iigyiiemck 8641 adlgdwhkvn aeacvktryt vtdlqageey kfrvsainga gkgdscevtg tikavdrlta 8701 peldidanfk qthvvragas irlfiayqgr ptptavwskp dsnlslradi httdsfstlt 8761 vencnrndag kytltvenns gsksitftvk vldtpgppgp itfkdvtrgs atlmwdapll 8821 dggarihhyv vekreasrrs wqvisekctr qifkvndlae gvpyyfrvsa vneygvgepy 8881 empepivate qpapprrldv vdtskssavl awlkpdhdgg sritgyllem rqkgsdfwve 8941 aghtkqltft verlvektey efrvkaknda gysepreafs sviikepqie ptadltgitn 9001 qlitckagsp ftidvpisgr papkvtwkle emrlketdrv sitttkdrtt ltvkdsmrgd 9061 sgryfltlen tagvktfsvt vvvigrpgpv tgpievssvs aescvlswge pkdgggteit 9121 nyivekresg ttawqlvnss vkrtqikvth ltkymeysfr vssenrfgvs kplesapiia 9181 ehpfgptkrs yqt diqscrhvat kliqgneyif rvsavnhygk 901
• Un ejemplo de secuencia de una proteína ...

  
• Si bien el ejemplo corresponde a una proteína "gigante" (más de 9000 residuos), la mayoría de las proteínas tienen 100-1000 residuos
• Considere las secuencias peptídicas

  • WAGV
  • VGAW
• Las secuencias corresponden a


  • Moléculas iguales
  • Molécules diferentes, que al ser parcialmente o totalmente hidrolizadas dan mezclas de moléculas iguales
  • Molécules diferentes, que al ser parcialmente hidrolizadas dan mezclas de moléculas diferentes, pero al ser completamente hidrolizadas, dan mezclas de moléculas iguales
  • Molécules diferentes, que al ser parcialmente o totalmente hidrolizadas dan mezclas de moléculas diferentes
• WAGV


  1. Hidrólisis total: W, A, G, V

  2. Hidrólisis parcial: WAG, AGV, WA, GV, AG
• VGAW


  1. Hidrólisis total: W, A, G, V

  2. Hidrólisis parcial: VGA, GAW, VG, AW, GA
• De los átomos de C indicados como I y II, ¿cuál(es), si es que alguno es un Ca?
• Opciones


  • I solamente
  • II solamente
  • I y II
  • ni I ni II