KOH używany jest w celu rozpuszczeniamateriału białkowego i ułatwienia detekcji elementów grzybów , które nie są niszczone przez silne roztwory zasadowe . Aby zwiększyćkontrast między elementami grzybów a tłem można dodać barwniki , takie jak laktofenol .
Tusz jest dodawany jako materiał kontrastujący, barwiący tło. Barwnik używany głównie do wykrywania Cryptococcus spp. w płynie mózgowo-rdzeniowym i innych płynach ciała. Polisacharydowa otoczka Cryptococcus spp.nie absorbuje tuszu tworząc aureole wokół komórki drożdży.
Plyn Lugola dodawany jest do bezpośrednich preparatów pierwotniakówpasożytniczych w celu wzmocnieniakontrastustruktur wewnętrznych. Ułatwia odróżnienie między pierwotniakami a białymi krwinkamigospodarza.
Jest to barwienie najpowszechniej używane w laboratoriach mikrobiologicznych, tworzące podstawę do wydzielenia głównych grup bakterii (np. bakterie Gram-dodatnie , bakterie Gram-ujemne). Po utrwaleniu próbki na szkiełku mikroskopowym (przez podgrzewanie lub stosowanie alkoholu), nanoszony jest fiolet krystaliczny, a następnie dodawana jest jodyna (płyn Lugola) w celu wytworzenia kompleksu z podstawowym barwnikiem. Kolejno podczas odbarwianiaalkoholem lub acetonem kompleks jest zatrzymywany w bakteriach Gram-dodatnich, ale eliminowany w organizmach Gram-ujemnych. Następnie kontrastowe barwienie safraniną lub fuksyną uwidacznia się w organizmach Gram-ujemnych (stąd ich czerwony kolor). Stopień, w jakim mikroorganizm pozostanie wybarwiony, zależy od typu drobnoustroju, warunków posiewu i umiejętności osoby wykonującej barwienie.
Używane do detekcji i identyfikacjipierwotniaków w kale.Jajarobaków pasożytniczych i larwyzatrzymują barwnik i są dużo łatwiej identyfikowane w preparacie bezpośrednim przyżyciowym.
Zazwyczaj wykonywane w laboratoriach histologicznych częściej niż w laboratoriach mikrobiologicznych. Używane głównie do wykrywania elementów grzybów w tkance, chociaż inne organizmy (takie jak bakterie) mogą również zostać wykryte. Barwienie srebrem wymaga umiejętności, ponieważ niespecyficzne barwienie może uczynić preparat niemożliwym do zinterpretowania.
Używane głównie do wykrywaniaPneumocystis w próbkach z układu oddechowego.Cysty barwią się na kolor rudawy do fioletowego na jasnoniebieskim tle. Zabarwienie tła jest usuwane przez użycie utleniających związków siarki. Komórki drożdży również barwią się tą metodą i są trudne do odróżnienia od komórek Pneumocystis. Formy wegetatywne (trofozoity)pierwotniaków pasożytniczychnie barwią się. Wiele laboratoriów zastąpiło to barwienie specyficznym barwieniem fluorescencyjnym.
Barwienie pierwotniaków stanowiące alternatywę dla barwienia hematoksyliną żelazową.Pierwotniaki mają cytoplazmęniebieskawozieloną do purpurowej z czerwonym lub rudawymjądrem i ciałkami wtrętowymi; tło próbki jest zielone.
Używane do wykrywania pierwotniakówkrwi,ciałek wtrętowych wirusów, mikroorganizmów z rodzaju: Chlamydia,Borellia,Toksoplazma,Pneumocystis i Rickettsia. Używany jest wielokolorowy barwnik zawierający mieszaninę błękitu metylenowego, azuru B i eozyny Y. Barwnik Giemsy łączy błękit metylenowy i eozynę.Jony eozyny są naładowane ujemnie i barwią zasadowe składniki komórki na pomarańczowy do różowego, podczas gdy inne barwniki barwią kwasowe struktury komórki na różne odcienie od niebieskiego do purpurowego.Trofozoity pierwotniaków mają czerwonejądro i szarawoniebieskącyto- plazmę, wewnątrzkomórkowedrożdże i ciałka wtrętowe wirusów typowo barwią się na niebiesko.Riketsje,chlamydie i Pneumocystis spp. barwią się na purpurowo.
Używana do barwienia mykobakterii i innych mikroorganizmów kwasoopornych, które są barwione zasadowąfuksyną karbolową. Metoda opiera się na odbarwianiu w roztworach kwasowo-zasadowych pozostałych, niekwasoopornych bakterii. Tło jest barwione kontrastowobłękitem metylenowym. Organizmy kwasooporne są czerwone na jasnoniebieskim tle. Wchłanianie fuksyny karbolowej wymaga podgrzewania próbki (gorące barwienie kwasooporne).
Zimne barwienie w kierunku bakteriikwasoopornych (nie wymaga podgrzewania, tylko dłuższego czasu ekspozycji na fuksynę). Takie same zasady jak przy barwieniu metodą Ziehl-Neelsena.
Takie same zasady jak przy innych metodach w kierunku bakterii kwasoopornych, ale w tym przypadku przy podstawowym barwieniu używane są barwniki fluorescencyjne (auramina i rodamina), a nadmanganian potasu (silny czynnik utleniający) jest kontrastem i inaktywujeniezwiązanyfluorochrom. Organizmy świecą na żółtawozielono na czarnym tle.
W tym barwieniu używany jest słaby czynnik odbarwiający. O ile mykobakterie są wysoceoporne na odbarwianie przez kwasy, to inne organizmy kwasooporne odbarwiają się łatwiej (np. Nocardia,Rhodococcus, Tsukamurella, Gordonia,Cryptosporidium,Isospora,Sarcocystis i Cyclospora). Organizmy te mogą być barwione bardziej efektywnie z użyciem słabych czynników odbarwiających. Organizmy, które zachowująfuksynęwewnątrz komórki w tym barwieniu, są zaliczane do częściowokwasoopornych .
Używane jest do wykrywania bakterii i grzybów w próbkach klinicznych. Barwnik wnika do kwasów nukleinowych (natywnych i zdenaturowanych). W pHobojętnymbakterie,grzyby i elementy komórkowe barwią się jednolicie na kolor czerwonopomarańczowy. W pHkwaśnym natomiast mikroorganizmy zabarwione są na czerwonopomarańczowo a tło staje się zielonożółte.
Używane do wykrywania strukturgrzybów i Pneumocystis spp.Fluorescencyjny barwnik wiąże się z chityną i celulozą w ścianie komórkowej mikroorganizmów (wiele laboratoriów zastępuje tradycyjną metodę z KOH tym barwieniem).
Przeciwciała (monoklonalne lub poliklonalne) są znakowane barwnikiem fluorescencyjnym.Swoistykompleks z mikroorganizmem jest wykrywany poprzez obecnośćfluorescencji. Technika jest używana do wykrywania lub identyfikacji różnych mikroorganizmów (np. Streptococcus pyogenes, Bordetella,Francisiella,Legionella,Chlamydia Pneumocystis, Cryptosporidium,Giardia,wirus grypy, wirus Herpes simplex). Czułość i swoistość metody jest zależna od liczby organizmów obecnych w próbce i od jakości znakowanych przeciwciał używanych w teście.