Juan Álvarez gobernó brevemente a finales de 1855 y después dejó el poder en manos de Ignacio Comonfort, quien promulgó las leyes de Reforma, las cuales destituían los bienes inmuebles y redujeron el poder económico y la influencia del clero en asuntos públicos.
Las leyes de Reforma fueron principalmente: Juárez, Lerdo, Iglesias. También estaban las Ley Orgánica del Registro Civil y la Ley de Panteones.
Ley Juárez (1855)
Elaborada por Benito Juárez para erradicar los fueros al clero y a los militares.
Ley Lerdo (1856)
Elaborada por Miguel Lerdo de Tejada para desamortizar los bienes inmuebles del clero y campesinos, promoviendo el despojo agrario y los latifundios laicos.
Ley Iglesias (1857)
Elaborada por José María Iglesias para cancelar la práctica de imponer sanciones económicas por incumplimiento de votos monásticos.
El 18 de febrero de 1856,Ignacio Comonfot convoca a un Congreso Constituyente que se dividía en dos: Liberales moderados y puros.
Los liberales moderados buscaban restablescer la Constitución de 1824 y buscaban neutralidad entre iglesia y Estado.
Los liberales puros buscaban el Estado laico y promovieron la desamortiazión de bienes clericales y abolición de fueros.
Participantes del Congreso Consituyente:
Benito Juárez.
Miguel Lerdo de Tejada.
José María Iglesias.
Melchor Ocampo.
Ponciano Arriaga.
Valentín Gómez Farias.
El Congreso Constituyente eliminó a la Cámara de Senadores, y con base en la Declaración de Derechos del Hombre se determinaron los derechos, libertades y obligaciones de los ciudadanos.
El 5 de febrero de 1857, Ignacio Comonfort promulga la Constitución liberal, con las siguientes características: Régimen laico, una República, federalismo y las garantías individuales.
Las garantías individuales incluían la libertad de xpresión, la libre asociación, libertad de culto, tránsito, propiedad y la igualdad civil.
Pelagio Antonio y el general Antonio Haro y Tamariz realizaron una rebelión en contra de la ley Lerdo en 1856.
El papa Pío IX apoyó a Pelagio Labastida y a Félix Zuloaga (enemigo de la Constitución).
Los aspectos positivos de las leyes de Reforma y de la Constitución de 1857 fueron:
Consolidación del federalismo y división de poderes.
Fortalecimiento de los derechos civiles.
Circulación de la riqueza del clero.
Los aspectos negativos de las leyes de Reforma y de la Constitución de 1857 fueron:
Despojo a los campesinos de sus tierras.
Fomentó del régimen latifundista.
Agudizó la rivalidad entre liberales y conservadores.