Sunod-sunod ang pagkatalo ng mga Pilipino laban sa mga Amerikano kaya napilitang tumakas si Pangulong Aguinaldo patungong hilagang Luzon. Noong ika-13 ng Marso, 1901, siya ay nadakip sa bayan ng Palanan, lalawigan ng Isabela. Pagkatapos ng ilang buwan, siya ay nanumpa ng katapatan sa Estados Unidos.