1. Prélèvement d'une quantité définie d'ADN du patient et d'une référence
2. Coloration des deux génomes et clivage en 180 000 fragments
3. Mélange des fragments et étalement sur la micro-puce
4. Appariement des fragments avec les séquences artificielles des puits
5. Analyse des résultats par scanner et programme informatique