VO 4 Genetik

• Wobble base pairs allow tRNA to decode different codons.
• There are three possible codes for each sequence, but only one sequence results in a longer open reading frame defined by a start and stop codon.
• There are 16 types of network effects.
• Durch Kombination verschiedener Faktoren kann eine große Zahl an Genen mit einer limitierten Zahl an Transkriptionsfaktoren kontrolliert werden.
• Globale Regulation: Histon Modifikationen können Transkription regulieren indem Chromatin mehr oder weniger zugänglich verpackt wird (längerfristiger Einfluss auf die Genregulation).
• Methylierung von CpG islands kann die Transkription inhibieren (Mittel- bis längerfristige Regulation).
• Methylierte Cytosine befinden sich in der Promotorregion von inaktiven Genen (als CpG islands).
• Das lac-Operon kodiert für ß-Galactosidase (lacZ), Lactose permease (lacY) und ß-Galactosid-Transacetylase (lacA).
• Die Anwesenheit von Lactose und die Abwesenheit von Glukose induzieren die Expression dieser Gene 1000-fach.
• Mutationen identifizierten eine Region als Operator (LacO) und eine als Repressor (lacI).
• DNA-bindende Proteine erkennen kleine Moleküle und wirken als Aktivatoren oder Repressoren der Transkription.
• Allolaktose bindet den Repressor und verhindert dessen Bindung an den Operator.
• Glukose reprimiert die Expression des Lac-Operons und führt zu niedrigen cAMP-Levels.
• Lactose induziert die Produktion von ß-Galaktosidase.
• Ein Tetramer des Repressors bindet an den Operator und inhibiert die Transkription.
• Gene für bestimmte Stoffwechselwege sind oft gekoppelt und kodieren für Polycistronische RNA.
• Each tRNA is loaded with a specific amino acid
• The carboxyl group of the amino acid binds to the 3' or 2' OH of the tRNA
• Ribosomal RNA has structural and catalytic functions
• tRNAs bring amino acids to the ribosome
• In bacteria, the first amino acid is modified (fMET = formylmethionine)
• All tRNAs have a CCA sequence at their 3' end
• Translation is regulated in three phases: initiation, elongation, and termination
• The Shine-Dalgarno sequence of mRNA base pairs with rRNA
• The anticodon of tRNA base pairs with the codon of mRNA
• Translation occurs from the 5' to 3' end of mRNA
• tRNAs adopt a cloverleaf structure through base pairings
• Aminoacyl-tRNA synthetase loads tRNAs using ATP
• fMET tRNA is distinguished from normal MET tRNA by IF2 and GTP
• Bacterial and eukaryotic ribosomes are similar
• In prokaryotes, initiation is regulated by initiation factors
• Translation begins with a methionine (AUG)
• Das trp-operon kodiert für Proteine der Tryptophan-Biosynthese und ist durch Tryptophan reprimmiert.
• Gal4p bindet an die Gal UAS = UPSTREAM ACTIVATING SEQUENCE.
• Gal-80 blockiert die activation domain von Gal4.
• Das Ribosom "stalled" bei den Trp codons in Abwesenheit von genügend Trp.
• Transkriptionskontrolle erfolgt über Aktivatoren, welche an DNA binden.
• SHRs binden hormone receptor elements (HREs) an der DNA und regulieren so die Transkription bestimmter Gene.
• Genregulation in Eukaryoten kann auf mehreren Ebenen erfolgen: Transkriptionskontrolle, Regulation des RNA-Processings, RNA Stabilität, Translationskontrolle, Proteinstabilität, Protein Modifikation.
• Aktivierung von Galactose fermentierenden Enzymen in der Hefe: Der Transkriptionsaktivator Gal4p wird nur in der Abwesenheit von Glukose synthetisiert.