ADN

• Quelles sont les différences entre ADN et ARN ?

  sucres, doubles / simple brins, bases
• Quelles bases sont des purines ?

  A et G
• Quelles bases sont des pyrimidines ?

  C, T et U
• Combien de ponts H forment respectivement A avec T et C avec G ?

  2 et 3
• Règles Chargraff

  Les portions des bases azotés sont typiques pour chaque espèce, A+G = 50% T+C = 50%

  les proportions de A-T et C-G sont très semblables
• la réplication suit un modèle semi-conservatif
• L’origine de réplication est une région de l’ADN permettant de recruter le complexe d’initiation de la réplication => 1 œil de réplication + 2 fourches.

  Chez procaryotes => 1 origine de réplication 

  Chez eucaryotes => plusieurs origines de réplication pour accélérer
• Dans l’ordre, quelles enzymes interviennent dans l’initiation de la réplication ?

  1. ADN gyrase
  2. hélicase
  3. protéines fixatrices d’ADN monocaténaire
  4. primase
• l‘ADN polymérase ne peut ajouter des nucléotides qu’à l’extrémité 3’ du brin synthétisé
• Quel mécanisme permet de contrer le raccourcissement des télomères ?

  la télomérase rallonge l’extrémité 3’ du brin matrice pour que le bout qui ne peut pas être répliqué ne soit pas de l’information génétique.
• Où se passe respectivement la transcription et la traduction des procaryotes ?

  cytoplasme ADN —> ARNm —> polypeptide
• où se passe respectivement la transcription et la traduction des eucaryotes ?

  noyau ADN —> ARNprem, maturation ARNprem —> ARNm, cytoplasme ARNm —> polypeptide
• Le promoteur est une séquence d’ADN signalant à l’ARN poylmérase où commencer la transcription.
• Qu’est-ce que le facteur sigma ?

  Le facteur sigma est une sous-unité de l’ARN polymérase qui permet la fixation sur l’ADN (séquence -35 et -10 sur le promoteur). Il n’entre pas en jeu dans l’élongation (se détache quand l’élongation commence).
• Opéron: unité transcriptionnelle qui contient plusieurs gènes => 1 seul ARN pour plusieurs gènes (même promoteur)
• Diauxie: phase de croissance discontinue
• Facteurs de transcriptions: protéines qui se lient à des séquences d'ADN spécifiques pour réguler l'expression d'un gène.
• Quels sont les motifs de liaisons des facteurs de transcription ?

  hélice-boucle-hélice, Doigt de zinc, Leucine zipper
• Élément de contrôle distal (enhancer): séquence d’ADN en amont du promoteur sur laquelle des activateurs ou répresseurs se lient pour réguler l’expression d’un gène
• Les activateurs/répresseurs sont spécifiques au type de cellules (tissus) => permettent de réguler l’expression des gènes. Les facteurs de transcription ne sont pas spécifiques
• De quoi est composé le promoteur eucaryote ?

  boîte TATA sur laquelle les facteurs de transcription viennent se lier. La liaison des facteurs de transcription + protéines médiatrices = complexe d’initiation capable de recruter l’ARN polymérase
• En quoi consiste la maturation de l’ARNprem ?

  coiffe 5’, queue poly-A, épissage des introns
• En quoi consiste l’ajout de la coiffe 5’ ?

  guanosine méthylée ajouté à l’extrémité 5’ de l’ARNprem

  Peut être ajouté assez rapidement car l’extremité 5’ est disponible pendant la transcription

  Fonctions: stabilisation, exportation du noyau au cytoplasme, Recrute le complexe d’initiation de la traduction
• en quoi consiste l’ajout de la queue poly-A ?

  Région riche en U sur ARNprem clivée

  Groupe hydroxyle libre = signal de polyadénisation

  Poly-adénine polymérase ajoute des A => besoin d’ATP
• quelles sont les fonctions de la queue poly-A ?

  stabilisation, initiation de la traduction
• Exons: partie d’ARN prémessager qui contient l’information génique codante pour les protéines (25% du transcrit primaire)
• Introns: parties d’ARNm non codantes pour les protéines
• Épissage des introns:

  1. ARNsn + protéines = complexe d’épissage = splicoesome 
  2. ARNsn reconnaît les séquences spécifiques à chaque extrémité des introns
  3. Intron excisé en lasso 
  4. Exons mis bout à bout 
• Qu’est-ce que l’épissage différentiel ?


  Le même preARNm peut donner des protéines différentes => Enlève pas toujours les mêmes exons => pas les mêmes ARNm => protéines différentes =>  variabilité 
• Quelles sont les caractéristiques du code génétique ?

  universel, dégénéré = plusieurs codons pour 1 acide aminé, non ambigu = 1 codon = 1 acide aminé
• ARNt

  Simple brin forme des appariements (replis) => structure 3D

  Anticodon complémentaire au codon de l’ARNm 

  I = base spécifique aux anticodons qui reconnaît A, C et G
• appariement Wobble: flexibilité particulière permettant à un ARNt de reconnaître plusieurs codons => précision de la synthèse protéique.
•  Aminoasyl-tRNA-synthéthase:

  1. L’ARNt et l’acide aminé correspondant à l’anticodon se lient sur le site actif
  2. la synthétase catalyse la liaison entre l’acide aminé et l’ARNt => ATP
  3. L’ARNt lié à son acide aminé est libéré du site actif de la synthétase
• Les ribosomes sont formés de 2 sous-unités composées d’ARNr
• initiation de la traduction chez les procaryotes:

  Le ribosome s’assemble sur une séquence Shine-Dalgarno. On retrouve ces séquences en amont de chaque gène d’un ARNm polycistronique permettant la synthèse simultanée de plusieurs protéines.
• Initiation de la traduction chez les eucaryotes:

  1. Les facteurs d’initiation se lient à la coiffe en 5’ et la queue poly-A de l’ARNm => signal pour le complexe (ARNt + petite sous-unité) de se lier
  2. Le complexe d’initiation glisse le long de l’ARNm pour trouver le codon start => ATP
  3. Les facteurs d’initiation se dissocient (vérification que l’ARNt corresponde bien au codon start) => GTP 
  4. Grande sous-unité se lie 
• Facteurs de terminaison de classe I: reconnaissent le codon STOP et se placent au site A. Ils catalysent l’hydrolyse du peptide (GTP) et la libération de l’ARNt
• Facteurs de terminaison de classe II: contribuent à la libération de RF1 et à la dissociation du ribosome (=> réutilisé pour une autre synthèse) => GTP
• mutation faux-sens: AA différents
• mutation non-sens: codon stop