Nuijasodan päätyttyä Klaus Fleming kuoli sairauteen, ja kuningas Sigismund menetti näin tärkeän tukijansa Suomessa. Kaarle halusi yhä syrjäyttää Sigismundin kuninkaan paikalta ja tulla itse valituksi Ruotsin kuninkaaksi. Niinpä Kaarle kaappasi vallan vuonna 1597 valtiopäivillä ja julistautui valtionhoitajaksi. Sigismund yritti päästä takaisin valtaan Ruotsissa sotimalla, mutta hänen joukkonsa hävisivät taisteluissa Kaarlen joukoille.