DUVAL 1 et 2

• Un virus n’est pas vivant car il n’est pas capable de se développer tout seul, car tant que le virus n’est pas capable d’infecter une cellule, il ne se passera rien
• Cycle de multiplication virale = complexe, il arrive que les cellules infectées ne produisent pas de virus ; parfois certains autres virus sont mal assemblés donc il y a perte de l’infectiosité.
• Diamètre (dimension) inférieur(e) à 250nm = invible à l’oeil, il faut un microscope électronique. On peut voir un effet cyto-pathogène, signe de l’infection au microscope « classique » (effet cytopathogène visible en MO, mais attention virus lui-même pas visible : besoin de passer au ME)

   
• Un seul type d’acide nucléique : ARN ou ADN
• Le virus a une absence d’équipement enzymatique pour la production d’énergie ! (Attention, certaines cellules possèdent des enzymes spécifiques de certains virus, impliquées dans transcription du génome, d’autres également dans maturation comme les protéases)
• Absence de division binaire ce qui signifie qu’un virus ne peut pas en donner 2 autres
• On peut trouver des virus chez une bactérie-> Bactériophage
• Le virus est incapable de croître et de se diviser seul. Il ne peut pas faire de l’énergie. Tout le processus énergétique est fourni par la cellule qu’il parasite. 

   
• « Parasite » absolu de la cellule hôte (cellule permettant la multiplication du parasite, avec obligation de contact entre le virus et la cellule. On qualifiera cette cellule de « permissive »).
• Reproduction par réplication à partir de son seul matériel génétique.
• La vie parasitaire est variable : le virus Delta par exemple, qui n’a qu’un seul gène, parasite un autre virus (le VHB), alors que certains virus ont un génome codant pour des centaines de gènes. 
• Un virus peut facilement passer de l’Homme à l’animal et de l’animal à l’Homme 
• Trois théories de l’origine des virus :

  •      L’évolution régressive 

  •      L’origine cellulaire 

  •      Les entités indépendantes 
• Les 3 domaines de la vie sont bien définis, suivant un arbre phylogénétique basé sur la 16S ARNr qui montre l’existence de 3 branches de la vie 
• Les procaryotes sont divisés en 2: arche et bactéries
• Les mimivirus (retrouvés dans le permafrost) sont des entités ressemblant à un virus (très gros ++ <250nm) retrouvés au niveau de parasites.
• Structure générale d'une particule virale

  A) Glycoprotéines

  B) Capside

  C) Acides nucléiques

  D) Enveloppe

  
• Compléter

  A) 20 nm

  B) 350 nm

  C) acide nucléique

  D) génome

  E) capside

  F) Enveloppe

  G) matrice protéique

  
• Acide nucléique viral

  A) ADN

  B) bicaténaire

  C) ARN

  D) monocaténaire

  
• Les catégories de génomes viraus

  A) double brin

  B) simple brin

  C) linéaire

  D) circulaire

  
• Génome à ADN bicaténaire (deux brins) linéaire : herpesvirus
• Génome à ADN bicaténaire (deux brins) circulaire: papillomavirus
• Génome à ADN partiellement bicaténaire: VHB
• Génome à ADN monocaténaire: Parvovirus 
• Génome à ARN monocaténaire linéaire parfois segmenté: Orthomyxovirus
• Génome à ARN bicaténaire et segmenté: Reovirus
• Dans les grandes catégories de génomes viraux, on en trouve à polarité positive (+) et d’autres à polarité négative (-). 
• Dans le premier cas à polarité +, le génome ARN peut directement servir d’ARN messager donc de matrice pour synthétiser des protéines : dans le second cas à polarité -, il ne peut pas servir à la synthèse protéique, il doit être rétrotranscrit en ARNm pour cela.
• On parle de polarité de virus uniquement pour les virus à ARN simple brin 
• Un virus de polarité + veut dire que ce génome peut directement servir de matrice pour la synthèse de protéine. C’est l’équivalement d’un ARN messager.
• Attention, très important : Ne pas confondre capside virale et capsule bactérienne
• La capside est solide et permet de reproduire d’ autres particules virales
•  Le génome ne peut pas être plus grand que la capside.
• On connait le virus, on a une cible thérapeutique puis un médicament.
• La capside virale est constante et permet de limiter la taille du génome viral
• Cette capside est de nature protéique, elle est édifiée à partir de polymérisation d’un petit nombre de sous-unités protéiques.
• La capside est organisée selon différentes géométries, avec 2 principaux types de symétrie :  Hélicoïdale (en hélice) ou Cubique (en icosaèdre). 
• La nucléocapside à symétrie hélicoïdale 

   

  Le nombre de sous-unités (abrégée « s/u ») protéiques

  La présence ou non de tours (ou « Pas »)

  L’angle ϕ (phi)Le diamètre 

  •      La longueur de l’hélice.

  Nucléocapside = capside structuré, polymérisé autour d’un acide nucléique.

   
• La nucléocapside à symétrie hélicoïdale :

  Le nombre de sous-unités (abrégée « s/u ») protéiques

  La présence ou non de tours (ou « Pas »)

  L’angle ϕ (phi)

  Le diamètre 

  La longueur de l’hélice.

   
• Nucléocapside = capside structuré, polymérisé autour d’un acide nucléique.