Mycology

• Propriétés générales des champignons

  • Le règne des champignons est très diversifié
  • ~ 150,000 espèces
  • 2-4 millions estimées (> 5 % caractérisées)
  • Eucaryotes

  
• Propriétés générales des champignons

  • Micromycètes: Levures et moisissures (Microscopiques)
  • Macromycètes: Champignons macroscopiques Sporophores/Condiophores visibles

  
• Champigons/Mycètes/Fungi

  • Organismes eucaryotes
  • Sans chlorophylle
  • Porteurs de spores
  • Nutrition par absorption et utilisent le carbone organique (Hétérotrophes)
  • Reproduction souvent asexuée, rarement sexuée
  • Leur paroi cellulaire contient typiquement de la chitine et des glucanes
  • Elles sont pour la plupart saprophytiques; moins de 100 sont reconnus pathogènes de l'Homme
• Morphologies des champignons


  • Levures (forme levuriforme)
  • Moisissures (champignons filamenteux)
  • Champignons dimorphiques (différencient à la fois des filaments et des levures)

  
• Levures

  • La forme la plus simple des champignons
  • Se multiplie par bourgeonnement (Saccharomyces cerevisiae et C. albicans -A) ou par fission (Schizosaccharomyces pombe- B)
  • Les levures pathogènes de l'Homme sont nommées Blastoconidies/blastospores (C. albicans)

  
• Moisissures

  • Cellules filamenteuses et cylindriques souvent branchées nommées hyphes
  • Une masse d'hyphes = Mycélium
  • Hyphes avec (Aspergillus) ou sans septum (Mucor)
  • Pseudohyphes Morphologie associée aux levures et distincte de la forme levure et la forme hyphale. Cellules levuriformes allongées et attachées (en forme de collier)

  
• Champignons dimorphiques


  • Le dimorphisme est une caractéristique de plusieurs champignons pathogènes endémiques comme Blastomyces et Histoplasma
  • Filamenteux à ~ 25°C (dans l'environnement/sol)
  • Levures à 37°C température corporelle. Ce changement morphologique (morphogenèse) est une caractéristique d'identification de ces champignons au laboratoire

  
• Reproduction


  • Reproduction asexuée/multiplication végétative
  • Reproduction sexuée
• Reproduction asexuée/multiplication végétative


  • Production de spores: Endospores (produites à l'intérieur du sporocyste), Exospores (générées à l'extrémité des filaments/hyphes), Blastospores (propagules issues de bourgeonnement)
  • Fragmentation de mycélium: Spores formées à la suite de fragmentation d'hyphes/filaments
  • Production de stolons: Propagation par extension des filaments

  
• Reproduction sexuée


  • Fusion de deux gamètes (Isogamie) ou de contenu cellulaire (Cystogamie/Plasmogamie) pour donner naissance à un zygote
  • Formation de spores après méiose dans des structures spécialisées: Asques contenant des ascospores (ascomycètes), Basides contenant des basidiospores (basidiomycètes)

  
• Classification taxonomique


  • Ascomycètes
  • Basidiomycètes
  • Glomeromycètes, Mucoromycètes et Mortierellomycota (Zygomycètes)
  • Microsporidies

  
• Ascomycètes


  • Représentent 75% des champignons connus
  • Levures ou filamenteux
  • Reproduction sexuée (ascospores) ou asexuée par bourgeonnement (blastospores/levures) ou par production de spores (conidies)

  
• Basidiomycètes


  • Reproduction sexuée par formation des basidiospores (basidium) ou des conidies
  • Apparences: Sporophore/carpophore, levures, filaments, capsules
• Glomeromycètes, Mucoromycètes et Mortierellomycota (Zygomycètes)


  • Forme primitive des champignons
  • Cellules coenocytiques (en majorité, mais exception existe)
  • Formation de zygospores (reproduction sexuée), sporocystes (reproduction asexuée)
  • Ectomycorhizes et endomycorhizes

  
• Microsporidies


  • Pathogènes intracellulaires de plusieurs animaux
  • Exemple: Agent de la pébrine (maladie du ver à soie), Nosema bombycis et de la Microsporidiose (Encephalitozoon)
• Caractéristiques de la cellule fongique

  • Noyau avec membrane nucléaire
  • Cytoplasme
  • Mitochondrie
  • Vacuole
  • Réseau de transport vésiculaire : Réticulum endoplasmique et Golgi
  • Membrane plasmique
  • Paroi cellulaire
• Membrane plasmique

  • Présence d'Érgosterol ("Cholestérol" fongique)
  • L'érgosterol est la cibles des antifongiques de la famille des Azoles et des Polyènes
• Paroi cellulaire

  • Couche externe: Mannanes et protéines pariétales
  • Couche intermédiaire: Glucane
  • Couche interne: Chitine
  • Présence de mélanine chez certains champignons filamenteux (Aspergillus, Alternaria)
• Composants de la paroi cellulaire

  • Chitine
  • Glucanes
  • Mannanes
  • Protéines pariétales
• Mode de vie et écologie des champignons

  • Saprophytes
  • Symbiotiques
  • Pathogènes/opportunistes
  • Commensaux

  
• Mycoses: des infections fongiques touchant les animaux
• Nécrotrophe


  Tuent l'hôte pour se nourrir
• Biotrophe


  Se nourrissent de l'hôte vivante
• Champignons chez les animaux/l'Homme

  • Opportunistes (en condition d'immuno-supression)
  • Pathogènes stricts

  
• Commensaux


  Champignons faisant partie de la flore de plantes des animaux, de l'Homme et des plantes. Profitent de l'hôte sans causer de dommage. Ils peuvent être opportunistes dans certain contexte (Candida albicans)
• Commensaux deviennent pathogènes en perte des conditions opportuns
• Différence entre champignons et bactéries: les champignons sont des organismes eucaryotes

  
• Implication du fait que les champignons sont des organismes eucaryotes

  Avoir des cibles thérapeutiques similaires avec l'Homme, difficultés de développer des médicaments qui agissent sur les champignons sans toutefois nuire aux humains

  
• Mycoses

  Infections fongiques touchant les animaux incluant l'Homme. Peuvent être superficielles ou profondes et même systémiques
• Mycologie médicale

  Discipline distincte de la microbiologie médicale qui consiste à isoler et à caractériser des champignons pathogènes dans le but de caractériser l'origine mycologique ou non d'une pathologie

  
• Éclosion de Sporothrix schenckii (infections sous-cutanée) chez 3000 travailleurs miniers en Afrique du Sud (1941-1944)
• Apparition de zones endémiques aux USA (Histoplasma capsulatum, agent de l'Histoplasmose) pendant la 2ème guerre mondiale
• Ère de la suppression immunitaire et des mycoses opportunistes nosocomiales (Candidoses et aspergilloses): Chimiothérapie, Maintenance des greffons, VIH/SIDA, Maladies auto-immunitaires
• Classification des mycoses


  Basée sur la pathogenèse et les sites d'infections primaires: Mycoses superficielles, Mycoses cutanées, Infections opportunistes systémiques, Mycoses sous-cutanées, Mycoses endémiques
• Mycoses superficielles


  Infections de la couche supérieure morte kératinisée de l'épiderme, Infections causées par Malassezia, Problèmes majoritairement cosmétiques
• Mycoses cutanées


  Infections touchant la peau, les cheveux et les ongles, causées par des dermatophytes
• Mycoses opportunistes systémiques


  Infections de tous les organes par des champignons environnementaux (Aspergillus fumigatus), ou des endosymbiontes commensaux/Mycobiota (Candida albicans), touchant des patients dont le système immunitaire est compromis
• Mycoses sous-cutanées


  Mycoses d'implantations (suite à des piqûres ou des traumatismes transcutanés), causées par des champignons mélanisés

  
• Mycoses endémiques


  Champignons ayant une répartition géographique restreinte, causant majoritairement des infections pulmonaires qui peuvent évoluer en infections systémiques

  
• Exemples de mycoses endémiques

  • Histoplasmose
  • Blastomycoses
  • Coccidiomycose
  • Paracocciodomycoses
  • Peniciliose
  • Sporotrichose
  • Cryptococcus gatii