Nutrition par absorption et utilisent le carbone organique (Hétérotrophes)
Reproduction souvent asexuée, rarement sexuée
Leur paroi cellulaire contient typiquement de la chitine et des glucanes
Elles sont pour la plupart saprophytiques; moins de 100 sont reconnus pathogènes de l'Homme
Morphologies des champignons
Levures (forme levuriforme)
Moisissures (champignons filamenteux)
Champignons dimorphiques (différencient à la fois des filaments et des levures)
Levures
La forme la plus simple des champignons
Se multiplie par bourgeonnement (Saccharomyces cerevisiae et C. albicans -A) ou par fission (Schizosaccharomyces pombe- B)
Les levures pathogènes de l'Homme sont nommées Blastoconidies/blastospores (C. albicans)
Moisissures
Cellules filamenteuses et cylindriques souvent branchées nommées hyphes
Une masse d'hyphes = Mycélium
Hyphes avec (Aspergillus) ou sans septum (Mucor)
Pseudohyphes Morphologie associée aux levures et distincte de la forme levure et la forme hyphale. Cellules levuriformes allongées et attachées (en forme de collier)
Champignons dimorphiques
Le dimorphisme est une caractéristique de plusieurs champignons pathogènes endémiques comme Blastomyces et Histoplasma
Filamenteux à ~ 25°C (dans l'environnement/sol)
Levures à 37°C température corporelle. Ce changement morphologique (morphogenèse) est une caractéristique d'identification de ces champignons au laboratoire
Reproduction
Reproduction asexuée/multiplication végétative
Reproduction sexuée
Reproduction asexuée/multiplication végétative
Production de spores: Endospores (produites à l'intérieur du sporocyste), Exospores (générées à l'extrémité des filaments/hyphes), Blastospores (propagules issues de bourgeonnement)
Fragmentation de mycélium: Spores formées à la suite de fragmentation d'hyphes/filaments
Production de stolons: Propagation par extension des filaments
Reproduction sexuée
Fusion de deux gamètes (Isogamie) ou de contenu cellulaire (Cystogamie/Plasmogamie) pour donner naissance à un zygote
Formation de spores après méiose dans des structures spécialisées: Asques contenant des ascospores (ascomycètes), Basides contenant des basidiospores (basidiomycètes)
Classification taxonomique
Ascomycètes
Basidiomycètes
Glomeromycètes, Mucoromycètes et Mortierellomycota (Zygomycètes)
Microsporidies
Ascomycètes
Représentent 75% des champignons connus
Levures ou filamenteux
Reproduction sexuée (ascospores) ou asexuée par bourgeonnement (blastospores/levures) ou par production de spores (conidies)
Basidiomycètes
Reproduction sexuée par formation des basidiospores (basidium) ou des conidies
Glomeromycètes, Mucoromycètes et Mortierellomycota (Zygomycètes)
Forme primitive des champignons
Cellules coenocytiques (en majorité, mais exception existe)
Formation de zygospores (reproduction sexuée), sporocystes (reproduction asexuée)
Ectomycorhizes et endomycorhizes
Microsporidies
Pathogènes intracellulaires de plusieurs animaux
Exemple: Agent de la pébrine (maladie du ver à soie), Nosema bombycis et de la Microsporidiose (Encephalitozoon)
Caractéristiques de la cellule fongique
Noyau avec membrane nucléaire
Cytoplasme
Mitochondrie
Vacuole
Réseau de transport vésiculaire : Réticulum endoplasmique et Golgi
Membrane plasmique
Paroi cellulaire
Membrane plasmique
Présence d'Érgosterol ("Cholestérol" fongique)
L'érgosterol est la cibles des antifongiques de la famille des Azoles et des Polyènes
Paroi cellulaire
Couche externe: Mannanes et protéines pariétales
Couche intermédiaire: Glucane
Couche interne: Chitine
Présence de mélanine chez certains champignons filamenteux (Aspergillus, Alternaria)
Composants de la paroi cellulaire
Chitine
Glucanes
Mannanes
Protéines pariétales
Mode de vie et écologie des champignons
Saprophytes
Symbiotiques
Pathogènes/opportunistes
Commensaux
Mycoses: des infections fongiques touchant les animaux
Nécrotrophe
Tuent l'hôte pour se nourrir
Biotrophe
Se nourrissent de l'hôte vivante
Champignons chez les animaux/l'Homme
Opportunistes (en condition d'immuno-supression)
Pathogènes stricts
Commensaux
Champignons faisant partie de la flore de plantes des animaux, de l'Homme et des plantes. Profitent de l'hôte sans causer de dommage. Ils peuvent être opportunistes dans certain contexte (Candida albicans)
Commensaux deviennent pathogènes en perte des conditions opportuns
Différence entre champignons et bactéries: les champignons sont des organismes eucaryotes
Implication du fait que les champignons sont des organismes eucaryotes
Avoir des cibles thérapeutiques similaires avec l'Homme, difficultés de développer des médicaments qui agissent sur les champignons sans toutefois nuire aux humains
Mycoses
Infections fongiques touchant les animaux incluant l'Homme. Peuvent être superficielles ou profondes et même systémiques
Mycologie médicale
Discipline distincte de la microbiologie médicale qui consiste à isoler et à caractériser des champignons pathogènes dans le but de caractériser l'origine mycologique ou non d'une pathologie
Éclosion de Sporothrix schenckii (infections sous-cutanée) chez 3000 travailleurs miniers en Afrique du Sud (1941-1944)
Apparition de zones endémiques aux USA (Histoplasma capsulatum, agent de l'Histoplasmose) pendant la 2ème guerre mondiale
Ère de la suppression immunitaire et des mycoses opportunistes nosocomiales (Candidoses et aspergilloses): Chimiothérapie, Maintenance des greffons, VIH/SIDA, Maladies auto-immunitaires
Classification des mycoses
Basée sur la pathogenèse et les sites d'infections primaires: Mycoses superficielles, Mycoses cutanées, Infections opportunistes systémiques, Mycoses sous-cutanées, Mycoses endémiques
Mycoses superficielles
Infections de la couche supérieure morte kératinisée de l'épiderme, Infections causées par Malassezia, Problèmes majoritairement cosmétiques
Mycoses cutanées
Infections touchant la peau, les cheveux et les ongles, causées par des dermatophytes
Mycoses opportunistes systémiques
Infections de tous les organes par des champignons environnementaux (Aspergillus fumigatus), ou des endosymbiontes commensaux/Mycobiota (Candida albicans), touchant des patients dont le système immunitaire est compromis
Mycoses sous-cutanées
Mycoses d'implantations (suite à des piqûres ou des traumatismes transcutanés), causées par des champignons mélanisés
Mycoses endémiques
Champignons ayant une répartition géographique restreinte, causant majoritairement des infections pulmonaires qui peuvent évoluer en infections systémiques