Mécanisme de la contamination et signes cliniques varient en fonction du type d'immunodépression (SIDA), le plus souvent réactivation de kystes cérébraux consécutifs à une toxoplasmose acquise faite antérieurement, risque important quand le taux de CD4+ du patient devient inférieur à 100/mm3, lésions cérébrales avec fièvre, céphalées et troubles du comportement, lésions oculaires, soit réactivation de kystes du receveur (greffe de moelle) soit apport de kystes par le greffon (greffe cardiaque), manifestations d'une toxoplasmose aiguë disséminée