Il y a 4 principales classes de molécules organiques complexes, ce sont les macromolécules : les glucides, les lipides, les protéines et les acides nucléiques. Parmi ces 4 macromolécules, 3 sont des polymères synthétisés à partir de monomères. Ce sont les glucides, les protéines et les acides nucléiques.
La cellule utilise 20 ou 22 acides aminés pour construire des milliers de protéines.
La nature de la chaine latérale détermine les caractéristiques d’un acide aminé. On a 9 acides aminés essentiels, on ne sait pas les synthétiser nous même à partir de précurseur.
Il y a des acides aminés polaires et apolaires. Certains ont une chaine latérale ionisée.
Une chaîne latérale ionisée est une partie d'un acide aminé (les blocs de construction des protéines) qui a gagné ou perdu un ou plusieurs électrons.
2 acides aminés sont liés par une liaison peptidique.
Il y a différentes structures d’acides aminés : primaire, secondaire, tertiaire et quaternaire.
Dans une protéine, il y a des interactions qui contribuent à sa conformation : liaison hydrogène, pont disulfure, liaison ionique, attraction de Van der Waals, exclusion hydrophobe.
La dénaturation inactive d’une enzyme est la perte de sa conformation.
Les liaisons covalentes disparaissent en présence d’agent réducteurs.
Si on chauffe, il n’y a plus d’activité.
Si on refroidi, on peut parfois récupérer la conformation de départ mais ce n’est pas toujours le cas.
Les protéines ont des fonctions très diversifiées : protéines enzymatiques, protéines structurales, protéines d’entreposage, protéines de transport, protéines hormonales, protéines réceptrices, protéines contractiles et motrices, protéines de défense.
La fonction enzymatique est sensible au milieu, elle sera sensible à la température et au pH.
La température à laquelle son activité sera maximale à une température légèrement supérieure à celle du milieu dans lequel elle se trouve.
Il y a 2 types d’inhibition : la compétitive et la non compétitive.
L’inhibiteur empêche le substrat de se fixer sur le site actif de l’enzyme.
Un cofacteur est une molécule liée à l’enzyme et nécessaire à son fonctionnement.
Si la molécule en question est organique, il s’agit d’une coenzyme.
Quand il y a l’inhibiteur compétitif, le substrat n’as pas accès à l’enzyme.
L’inhibiteur allostérique modifie la forme de l’enzyme, ce qui empêche la fixation du substrat.
Les sucres simples vont s'associer et former des polymères.
Selon leur structures, on classe les glucides en : Monosaccharides, Oligosaccharides et Polysaccharides.
Les Monosaccharides, ou "oses", sont des "sucres simples".
Les Oligosaccharides sont composés de 2 à 10 oses.
Les Disaccharides ou les Trisaccharides sont des exemples de glucides.
Sucrose, ou fructose, est un exemple de sucre ordinaire.
Les Polysaccharides ont plus de 10 oses.
Le glycogène, qui contient 30 000 monomères de glucose, est un exemple de polysaccharide.
Les Monosaccharides renferment toujours du C, du O et du H.
Les Monosaccharides sont des composés contenant un groupe carbonyle (CO), au moins 3 atomes de C et au moins 2 groupements hydroxyle (OH).
La formule générale des Monosaccharides est Cn(H20)n.
L'exemple de glucose, C6H12O6, montre qu'il y a un nombre égal d’atomes de C et de molécules d’eau.
La structure d'un Monosaccharide contient 3 à 7 atomes de C, toujours des groupements hydroxyles, et soit un groupe aldéhyde, soit une cétone.
Les trioses sont une catégorie de sucres simples, ou monosaccharides, qui contiennent trois atomes de carbone dans leur structure moléculaire. Ils font partie des glucides, une classe importante de biomolécules.
Il existe deux principaux trioses en biochimie : le glyceraldehyde (ou glyceraldéhyde) et le dihydroxyacetone (ou dihydroxyacétone).
Le glyceraldehyde possède un groupe aldéhyde (-CHO) tandis que le dihydroxyacetone possède un groupe cétone (=CO).
On peut considérer les autres aldoses ou cétoses comme des dérivés du glycéraldéhyde et du dihydroxyacétone obtenus en ajoutant d’autres carbone, chacun porteur d’un hydroxyle.
L’arrangement spatial autour d’un atome de C asymétrique contribue à la diversité des monosaccharides.
Certaines oses ne diffèrent que par la position d’un groupement hydroxyle autour d’un carbone asymétrique.
Les monosaccharides de glucose, comme la majorité des oses, se présentent en réalité sous une forme cyclique.