La liaison covalente est la plus riche en énergie.
- Liaisons ioniques : 5-10 kcal/mol
Une charge négative et une charge positive s’associent. (Adrénaline par exemple)
- Liaisons hydrogène : 1-7 kcal/mol
Essentiel dans les interactions, généralement très nombreuses.
Accepteurs de liaison H : tous les C=O (ou NRR’) de la molécule ou de la protéine.
Donneurs de liaison H : résidus d’acides aminés à chaine latérale à protons mobiles.
- Liaisons hydrophobes : 1kJ/mol, ce sont les moins riches en énergie.
Liaison de Van der Waals (1kJ/mol)
Peptidoglycane = peptide + un sucre (N-acétyl glucosamine ou M = Acide N-acetyl muramique)
Les protéines ont une structure 3D donc les molécules bioactives qui réagissent avec elles doivent elles aussi avoir une structure tridimensionnelle.
Facteurs influençant l’absorption
Facteurs propres au PA :
o Taille de la molécule
o Solubilité au site d’absorption
o Degré d’ionisation au site d’absorption
o Solubilité dans les graisses
Facteurs influençant l’absorption : Nature de la structure membranaire : pour traverser les membranes biologiques, la bicouche phospholipidique la molécule doit être un peu soluble
Le passage membranaire
Peut se faire soit par :
- Transport actif
- Ou, surtout par diffusion passive
o Gradient de concentration,
o Masse moléculaire,
o Balance hydrophile/hydrophobe.
Plus le P est élevé : plus le principe actif est lipophile, plus la concentration en principe actif intracellulaire est grande, et plus rapide est l'absorption
La règle de Lipinski
- Une molécule à l’étude a bien plus de chance de montrer une bonne perméabilité si :
o Sa masse molaire n’est pas supérieure à 500g/mol
o Son logP n’est pas supérieur à 5
o Elle ne comporte pas plus de 5 donneurs de liaisons H (sommes des OH et des NH)
o Elle ne comporte pas plus de 10 accepteurs de liaisons H (somme des N et O)
Les meilleurs médicaments résultent d’un compromis : ni trop lipophiles ni trop hydrophiles
Lipophilie élevée est corrélée à une augmentation de
- L’absorption donc action plus rapide
- Pénétration par la peau
- Fixation aux protéines plasmatiques (Dérivés du cannabis : très lipophiles, se fixent dans les tissus gras 🡪 détectables et dosables pendant1 semaine dans notre sang)
- Stockage tissulaire
- Vitesse de métabolisme
Mais le PA doit être soluble dans les liquides biologiques aqueux
Le degré d’ionisation
- Molécules non ionisables : à l’équilibre, les concentrations en PA deviennent égales de part et d’autre de la membrane
- Molécules ionisables : l’équilibre dépend du pH
- L’ionisation dépend du pH du milieu et du pKa du PA
Un PA ionisé ne pourra JAMAIS passer une membrane lipidiques biologique ! il doit être sous forme NONionisée
Voir les exemples du cours !
Devenir d’un principe actif dans l’organisme : importance du métabolisme
Objectif de l’organisme : transformer la molécule de PA en un dérivé plus polaire, donc plus facilement éliminé, souvent dans les urines.
La règle de Lipinski : - Une molécule à l’étude a bien plus de chance de montrer une « bonne perméabilité » si :
o Sa masse molaire n’est pas supérieure à 500g/mol
o Son logP n’est pas supérieur à 5
o Elle ne comporte pas plus de 5 donneurs de liaisons H (sommes des OH et des NH)
o Elle ne comporte pas plus de 10 accepteurs de liaisons H (somme des N et O)
Les meilleurs médicaments résultent d’un compromis : ni trop lipophiles ni trop hydrophiles